Thừa Thiên – Huế là trung tâm y tế chuyên sâu của khu vực miền Trung – Tây Nguyên và cả nước với 3 đơn vị đang được nhà nước đầu tư triển khai thực hiện dự án Trung tâm Y tế chuyên sâu khu vực miền Trung – Tây Nguyên và cả nước là: Bệnh viện Trung ương Huế, Trường Đại học Y Dược Huế và Trung tâm Kiểm nghiệm dược phẩm, hóa mỹ phẩm Trung ương.

Các bệnh viện trên địa bàn tỉnh

• Bệnh viện Trung ương Huế: Bệnh viện tuyến Trung ương (hơn 2000 giường): Là bệnh viện hạng đặc biệt duy nhất của khu vực miền Trung và Tây Nguyên
• Bệnh viện Quốc tế Huế (200 giường)
• Bệnh viện Trường Đại học Y - Dược Huế: Bệnh viện hạng II tuyến trung ương (gần 700 giường)
• Bệnh viện Trung ương Huế cơ sở 2 (huyện Phong Điền) (500 giường)
• Bệnh viện Đa Khoa Hoàng Viết Thắng (90 giường).
• Bệnh viện Ngoại Khoa Nguyễn Văn Thái (30 giường).
• Bệnh viện Giao thông Vận tải Huế
• Bệnh viện Y học cổ truyền
• Bệnh viện Điều Dưỡng và Phục hồi chức năng
• Bệnh viện Răng Hàm Mặt Huế
• Bệnh viện Mắt Huế
• Bệnh viện Tâm thần
• Bệnh viện Đa Khoa Chân Mây
• Bệnh viện Bình Điền
• Bệnh viện Chấn thương chỉnh hình – Phẫu thuật tạo hình
• Bệnh viện Quân y 268
• Bệnh viện Lao và Bệnh phổi Thừa Thiên Huế
• Bệnh viện Phong và Da liễu Huế
• Bệnh viện Đa khoa Khu 3